Novel risk loci for COVID-19 hospitalization among admixed American populations

Abstract The genetic basis of severe COVID-19 has been thoroughly studied and many genetic risk factors shared between populations have been identified. However, reduced sample sizes from non-European groups have limited the discovery of population-specific common risk loci. In this second study nested in the SCOURGE consortium, we have conducted the largest GWAS meta-analysis for COVID-19 hospitalization in admixed Americans, comprising a total of 4,702 hospitalized cases recruited by SCOURGE and other seven participating studies in the COVID-19 Host Genetic Initiative. We identified four genome-wide significant associations, two of which constitute novel loci and first discovered in Latin-American populations (BAZ2BandDDIAS). A trans-ethnic meta-analysis revealed another novel cross-population risk locus inCREBBP. Finally, we assessed the performance of a cross-ancestry polygenic risk score in the SCOURGE admixed American cohort..

Medienart:

Preprint

Erscheinungsjahr:

2024

Erschienen:

2024

Enthalten in:

bioRxiv.org - (2024) vom: 10. Feb. Zur Gesamtaufnahme - year:2024

Sprache:

Englisch

Beteiligte Personen:

Almeida, Silvia Diz-de [VerfasserIn]
Cruz, Raquel [VerfasserIn]
Luchessi, Andre D. [VerfasserIn]
Lorenzo-Salazar, José M. [VerfasserIn]
de Heredia, Miguel López [VerfasserIn]
Quintela, Inés [VerfasserIn]
González-Montelongo, Rafaela [VerfasserIn]
Silbiger, Vivian N. [VerfasserIn]
Porras, Marta Sevilla [VerfasserIn]
Castaño, Jair Antonio Tenorio [VerfasserIn]
Nevado, Julian [VerfasserIn]
Aguado, Jose María [VerfasserIn]
Aguilar, Carlos [VerfasserIn]
Aguilera-Albesa, Sergio [VerfasserIn]
Almadana, Virginia [VerfasserIn]
Almoguera, Berta [VerfasserIn]
Alvarez, Nuria [VerfasserIn]
Andreu-Bernabeu, Álvaro [VerfasserIn]
Arana-Arri, Eunate [VerfasserIn]
Arango, Celso [VerfasserIn]
Arranz, María J. [VerfasserIn]
Artiga, Maria-Jesus [VerfasserIn]
Baptista-Rosas, Raúl C. [VerfasserIn]
Sánchez, María Barreda- [VerfasserIn]
Belhassen-Garcia, Moncef [VerfasserIn]
Bezerra, Joao F. [VerfasserIn]
Bezerra, Marcos A.C. [VerfasserIn]
Boix-Palop, Lucía [VerfasserIn]
Brion, María [VerfasserIn]
Brugada, Ramón [VerfasserIn]
Bustos, Matilde [VerfasserIn]
Calderón, Enrique J. [VerfasserIn]
Carbonell, Cristina [VerfasserIn]
Castano, Luis [VerfasserIn]
Castelao, Jose E. [VerfasserIn]
Vicente, Rosa Conde- [VerfasserIn]
Cordero-Lorenzana, M. Lourdes [VerfasserIn]
Cortes-Sanchez, Jose L. [VerfasserIn]
Corton, Marta [VerfasserIn]
Darnaude, M. Teresa [VerfasserIn]
Martino-Rodríguez, Alba De [VerfasserIn]
del Campo-Pérez, Victor [VerfasserIn]
de Bustamante, Aranzazu Diaz [VerfasserIn]
Domínguez-Garrido, Elena [VerfasserIn]
Eirós, Rocío [VerfasserIn]
Fariñas, María Carmen [VerfasserIn]
Fernandez-Nestosa, María J. [VerfasserIn]
Fernández-Robelo, Uxía [VerfasserIn]
Fernández-Rodríguez, Amanda [VerfasserIn]
Fernández-Villa, Tania [VerfasserIn]
Gago-Domínguez, Manuela [VerfasserIn]
Gil-Fournier, Belén [VerfasserIn]
Arrue, Javier Gómez- [VerfasserIn]
Álvarez, Beatriz González [VerfasserIn]
de Quirós, Fernan Gonzalez Bernaldo [VerfasserIn]
González-Neira, Anna [VerfasserIn]
González-Peñas, Javier [VerfasserIn]
Gutiérrez-Bautista, Juan F. [VerfasserIn]
Herrero, María José [VerfasserIn]
Herrero-Gonzalez, Antonio [VerfasserIn]
Jimenez-Sousa, María A. [VerfasserIn]
Lattig, María Claudia [VerfasserIn]
Borja, Anabel Liger [VerfasserIn]
Lopez-Rodriguez, Rosario [VerfasserIn]
Mancebo, Esther [VerfasserIn]
López, Caridad Martín- [VerfasserIn]
Martín, Vicente [VerfasserIn]
Martinez-Nieto, Oscar [VerfasserIn]
Martinez-Lopez, Iciar [VerfasserIn]
Martinez-Resendez, Michel F. [VerfasserIn]
Martinez-Perez, Ángel [VerfasserIn]
Mazzeu, Juliana F. [VerfasserIn]
Macías, Eleuterio Merayo [VerfasserIn]
Minguez, Pablo [VerfasserIn]
Cuerda, Victor Moreno [VerfasserIn]
Oliveira, Silviene F. [VerfasserIn]
Ortega-Paino, Eva [VerfasserIn]
Parellada, Mara [VerfasserIn]
Paz-Artal, Estela [VerfasserIn]
Santos, Ney P.C. [VerfasserIn]
Matute, Patricia Pérez- [VerfasserIn]
Perez, Patricia [VerfasserIn]
Pérez-Tomás, M. Elena [VerfasserIn]
Perucho, Teresa [VerfasserIn]
Abuin, Mel·lina Pinsach- [VerfasserIn]
Pita, Guillermo [VerfasserIn]
Pompa-Mera, Ericka N. [VerfasserIn]
Porras-Hurtado, Gloria L. [VerfasserIn]
Pujol, Aurora [VerfasserIn]
León, Soraya Ramiro [VerfasserIn]
Resino, Salvador [VerfasserIn]
Fernandes, Marianne R. [VerfasserIn]
Rodríguez-Ruiz, Emilio [VerfasserIn]
Rodriguez-Artalejo, Fernando [VerfasserIn]
Rodriguez-Garcia, José A. [VerfasserIn]
Ruiz-Cabello, Francisco [VerfasserIn]
Ruiz-Hornillos, Javier [VerfasserIn]
Ryan, Pablo [VerfasserIn]
Soria, José Manuel [VerfasserIn]
Souto, Juan Carlos [VerfasserIn]
Tamayo, Eduardo [VerfasserIn]
Tamayo-Velasco, Alvaro [VerfasserIn]
Taracido-Fernandez, Juan Carlos [VerfasserIn]
Teper, Alejandro [VerfasserIn]
Torres-Tobar, Lilian [VerfasserIn]
Urioste, Miguel [VerfasserIn]
Valencia-Ramos, Juan [VerfasserIn]
Yáñez, Zuleima [VerfasserIn]
Zarate, Ruth [VerfasserIn]
de Rojas, Itziar [VerfasserIn]
Ruiz, Agustín [VerfasserIn]
Sánchez, Pascual [VerfasserIn]
Real, Luis Miguel [VerfasserIn]
Guillen-Navarro, Encarna [VerfasserIn]
Ayuso, Carmen [VerfasserIn]
Parra, Esteban [VerfasserIn]
Riancho, José A. [VerfasserIn]
Rojas-Martinez, Augusto [VerfasserIn]
Flores, Carlos [VerfasserIn]
Lapunzina, Pablo [VerfasserIn]
Carracedo, Ángel [VerfasserIn]

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570
Biology

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10.1101/2023.08.11.23293871

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XBI040542610