Detailed stratified GWAS analysis for severe COVID-19 in four European populations

ABSTRACT Given the highly variable clinical phenotype of Coronavirus disease 2019 (COVID-19), a deeper analysis of the host genetic contribution to severe COVID-19 is important to improve our understanding of underlying disease mechanisms. Here, we describe an extended GWAS meta-analysis of a well-characterized cohort of 3,260 COVID-19 patients with respiratory failure and 12,483 population controls from Italy, Spain, Norway and Germany/Austria, including stratified analyses based on age, sex and disease severity, as well as targeted analyses of chromosome Y haplotypes, the human leukocyte antigen (HLA) region and the SARS-CoV-2 peptidome. By inversion imputation, we traced a reported association at 17q21.31 to a highly pleiotropic ∼0.9-Mb inversion polymorphism and characterized the potential effects of the inversion in detail. Our data, together with the 5threlease of summary statistics from the COVID-19 Host Genetics Initiative, also identified a new locus at 19q13.33, includingNAPSA, a gene which is expressed primarily in alveolar cells responsible for gas exchange in the lung..

Medienart:

Preprint

Erscheinungsjahr:

2023

Erschienen:

2023

Enthalten in:

bioRxiv.org - (2023) vom: 05. Jan. Zur Gesamtaufnahme - year:2023

Sprache:

Englisch

Beteiligte Personen:

Degenhardt, Frauke [VerfasserIn]
Ellinghaus, David [VerfasserIn]
Juzenas, Simonas [VerfasserIn]
Lerga-Jaso, Jon [VerfasserIn]
Wendorff, Mareike [VerfasserIn]
Maya-Miles, Douglas [VerfasserIn]
Uellendahl-Werth, Florian [VerfasserIn]
ElAbd, Hesham [VerfasserIn]
Rühlemann, Malte C [VerfasserIn]
Arora, Jatin [VerfasserIn]
Özer, Onur [VerfasserIn]
Lenning, Ole Bernt [VerfasserIn]
Myhre, Ronny [VerfasserIn]
Vadla, May Sissel [VerfasserIn]
Wacker, Eike M [VerfasserIn]
Wienbrandt, Lars [VerfasserIn]
Ortiz, Aaron Blandino [VerfasserIn]
de Salazar, Adolfo [VerfasserIn]
Chercoles, Adolfo Garrido [VerfasserIn]
Palom, Adriana [VerfasserIn]
Ruiz, Agustín [VerfasserIn]
Garcia-Fernandez, Alba-Estela [VerfasserIn]
Blanco-Grau, Albert [VerfasserIn]
Mantovani, Alberto [VerfasserIn]
Zanella, Alberto [VerfasserIn]
Holten, Aleksander Rygh [VerfasserIn]
Mayer, Alena [VerfasserIn]
Bandera, Alessandra [VerfasserIn]
Cherubini, Alessandro [VerfasserIn]
Protti, Alessandro [VerfasserIn]
Aghemo, Alessio [VerfasserIn]
Gerussi, Alessio [VerfasserIn]
Ramirez, Alfredo [VerfasserIn]
Braun, Alice [VerfasserIn]
Nebel, Almut [VerfasserIn]
Barreira, Ana [VerfasserIn]
Lleo, Ana [VerfasserIn]
Teles, Ana [VerfasserIn]
Kildal, Anders Benjamin [VerfasserIn]
Biondi, Andrea [VerfasserIn]
Caballero-Garralda, Andrea [VerfasserIn]
Ganna, Andrea [VerfasserIn]
Gori, Andrea [VerfasserIn]
Glück, Andreas [VerfasserIn]
Lind, Andreas [VerfasserIn]
Tanck, Anja [VerfasserIn]
Hinney, Anke [VerfasserIn]
Nolla, Anna Carreras [VerfasserIn]
Fracanzani, Anna Ludovica [VerfasserIn]
Peschuck, Anna [VerfasserIn]
Cavallero, Annalisa [VerfasserIn]
Dyrhol-Riise, Anne Ma [VerfasserIn]
Ruello, Antonella [VerfasserIn]
Julià, Antonio [VerfasserIn]
Muscatello, Antonio [VerfasserIn]
Pesenti, Antonio [VerfasserIn]
Voza, Antonio [VerfasserIn]
Rando-Segura, Ariadna [VerfasserIn]
Solier, Aurora [VerfasserIn]
Schmidt, Axel [VerfasserIn]
Cortes, Beatriz [VerfasserIn]
Mateos, Beatriz [VerfasserIn]
Nafria-Jimenez, Beatriz [VerfasserIn]
Schaefer, Benedikt [VerfasserIn]
Jensen, Björn [VerfasserIn]
Bellinghausen, Carla [VerfasserIn]
Maj, Carlo [VerfasserIn]
Ferrando, Carlos [VerfasserIn]
de la Horra, Carmen [VerfasserIn]
Quereda, Carmen [VerfasserIn]
Skurk, Carsten [VerfasserIn]
Thibeault, Charlotte [VerfasserIn]
Scollo, Chiara [VerfasserIn]
Herr, Christian [VerfasserIn]
Spinner, Christoph D [VerfasserIn]
Gassner, Christoph [VerfasserIn]
Lange, Christoph [VerfasserIn]
Hu, Cinzia [VerfasserIn]
Paccapelo, Cinzia [VerfasserIn]
Lehmann, Clara [VerfasserIn]
Angelini, Claudio [VerfasserIn]
Cappadona, Claudio [VerfasserIn]
Azuure, Clinton [VerfasserIn]
Bianco, Cristiana [VerfasserIn]
Cea, Cristina [VerfasserIn]
Sancho, Cristina [VerfasserIn]
Lihaug Hoff, Dag Arne [VerfasserIn]
Galimberti, Daniela [VerfasserIn]
Prati, Daniele [VerfasserIn]
Haschka, David [VerfasserIn]
Jiménez, David [VerfasserIn]
Pestaña, David [VerfasserIn]
Toapanta, David [VerfasserIn]
Muñiz-Diaz, Eduardo [VerfasserIn]
Azzolini, Elena [VerfasserIn]
Sandoval, Elena [VerfasserIn]
Binatti, Eleonora [VerfasserIn]
Scarpini, Elio [VerfasserIn]
Helbig, Elisa T [VerfasserIn]
Casalone, Elisabetta [VerfasserIn]
Urrechaga, Eloisa [VerfasserIn]
Paraboschi, Elvezia Maria [VerfasserIn]
Pontali, Emanuele [VerfasserIn]
Reverter, Enric [VerfasserIn]
Calderón, Enrique J [VerfasserIn]
Navas, Enrique [VerfasserIn]
Solligård, Erik [VerfasserIn]
Contro, Ernesto [VerfasserIn]
Arana-Arri, Eunate [VerfasserIn]
Aziz, Fátima [VerfasserIn]
Garcia, Federico [VerfasserIn]
Sánchez, Félix García [VerfasserIn]
Ceriotti, Ferruccio [VerfasserIn]
Martinelli-Boneschi, Filippo [VerfasserIn]
Peyvandi, Flora [VerfasserIn]
Kurth, Florian [VerfasserIn]
Blasi, Francesco [VerfasserIn]
Malvestiti, Francesco [VerfasserIn]
Medrano, Francisco J [VerfasserIn]
Mesonero, Francisco [VerfasserIn]
Rodriguez-Frias, Francisco [VerfasserIn]
Hanses, Frank [VerfasserIn]
Müller, Fredrik [VerfasserIn]
Hemmrich-Stanisak, Georg [VerfasserIn]
Bellani, Giacomo [VerfasserIn]
Grasselli, Giacomo [VerfasserIn]
Pezzoli, Gianni [VerfasserIn]
Costantino, Giorgio [VerfasserIn]
Albano, Giovanni [VerfasserIn]
Cardamone, Giulia [VerfasserIn]
Bellelli, Giuseppe [VerfasserIn]
Citerio, Giuseppe [VerfasserIn]
Foti, Giuseppe [VerfasserIn]
Lamorte, Giuseppe [VerfasserIn]
Matullo, Giuseppe [VerfasserIn]
Baselli, Guido [VerfasserIn]
Kurihara, Hayato [VerfasserIn]
Neb, Holger [VerfasserIn]
My, Ilaria [VerfasserIn]
Kurth, Ingo [VerfasserIn]
Hernández, Isabel [VerfasserIn]
Pink, Isabell [VerfasserIn]
de Rojas, Itziar [VerfasserIn]
Galván-Femenia, Iván [VerfasserIn]
Holter, Jan Cato [VerfasserIn]
Afset, Jan Egil [VerfasserIn]
Heyckendorf, Jan [VerfasserIn]
Kässens, Jan [VerfasserIn]
Damås, Jan Kristian [VerfasserIn]
Rybniker, Jan [VerfasserIn]
Altmüller, Janine [VerfasserIn]
Ampuero, Javier [VerfasserIn]
Martín, Javier [VerfasserIn]
Erdmann, Jeanette [VerfasserIn]
Banales, Jesus M [VerfasserIn]
Badia, Joan Ramon [VerfasserIn]
Dopazo, Joaquin [VerfasserIn]
Schneider, Jochen [VerfasserIn]
Bergan, Jonas [VerfasserIn]
Barretina, Jordi [VerfasserIn]
Walter, Jörn [VerfasserIn]
Quero, Jose Hernández [VerfasserIn]
Goikoetxea, Josune [VerfasserIn]
Delgado, Juan [VerfasserIn]
Guerrero, Juan M [VerfasserIn]
Fazaal, Julia [VerfasserIn]
Kraft, Julia [VerfasserIn]
Schröder, Julia [VerfasserIn]
Risnes, Kari [VerfasserIn]
Banasik, Karina [VerfasserIn]
Müller, Karl Erik [VerfasserIn]
Gaede, Karoline I [VerfasserIn]
Garcia-Etxebarria, Koldo [VerfasserIn]
Tonby, Kristian [VerfasserIn]
Heggelund, Lars [VerfasserIn]
Izquierdo-Sanchez, Laura [VerfasserIn]
Bettini, Laura Rachele [VerfasserIn]
Sumoy, Lauro [VerfasserIn]
Sander, Leif Erik [VerfasserIn]
Lippert, Lena J [VerfasserIn]
Terranova, Leonardo [VerfasserIn]
Nkambule, Lindokuhle [VerfasserIn]
Knopp, Lisa [VerfasserIn]
Gustad, Lise Tuset [VerfasserIn]
Garbarino, Lucia [VerfasserIn]
Santoro, Luigi [VerfasserIn]
Téllez, Luis [VerfasserIn]
Roade, Luisa [VerfasserIn]
Ostadreza, Mahnoosh [VerfasserIn]
Intxausti, Maider [VerfasserIn]
Kogevinas, Manolis [VerfasserIn]
Riveiro-Barciela, Mar [VerfasserIn]
Berger, Marc M [VerfasserIn]
Schaefer, Marco [VerfasserIn]
Niemi, Mari EK [VerfasserIn]
Gutiérrez-Stampa, María A [VerfasserIn]
Carrabba, Maria [VerfasserIn]
Figuera Basso, Maria E. [VerfasserIn]
Valsecchi, Maria Grazia [VerfasserIn]
Hernandez-Tejero, María [VerfasserIn]
Vehreschild, Maria JGT [VerfasserIn]
Manunta, Maria [VerfasserIn]
Acosta-Herrera, Marialbert [VerfasserIn]
D’Angiò, Mariella [VerfasserIn]
Baldini, Marina [VerfasserIn]
Cazzaniga, Marina [VerfasserIn]
Grimsrud, Marit M [VerfasserIn]
Cornberg, Markus [VerfasserIn]
Nöthen, Markus M [VerfasserIn]
Marquié, Marta [VerfasserIn]
Castoldi, Massimo [VerfasserIn]
Cordioli, Mattia [VerfasserIn]
Cecconi, Maurizio [VerfasserIn]
D’Amato, Mauro [VerfasserIn]
Augustin, Max [VerfasserIn]
Tomasi, Melissa [VerfasserIn]
Boada, Mercè [VerfasserIn]
Dreher, Michael [VerfasserIn]
Seilmaier, Michael J [VerfasserIn]
Joannidis, Michael [VerfasserIn]
Wittig, Michael [VerfasserIn]
Mazzocco, Michela [VerfasserIn]
Ciccarelli, Michele [VerfasserIn]
Rodríguez-Gandía, Miguel [VerfasserIn]
Bocciolone, Monica [VerfasserIn]
Miozzo, Monica [VerfasserIn]
Ayo, Natale Imaz [VerfasserIn]
Blay, Natalia [VerfasserIn]
Chueca, Natalia [VerfasserIn]
Montano, Nicola [VerfasserIn]
Braun, Nicole [VerfasserIn]
Ludwig, Nicole [VerfasserIn]
Marx, Nikolaus [VerfasserIn]
Martínez, Nilda [VerfasserIn]
Cornely, Oliver A [VerfasserIn]
Witzke, Oliver [VerfasserIn]
Palmieri, Orazio [VerfasserIn]
Faverio, Paola [VerfasserIn]
Preatoni, Paoletta [VerfasserIn]
Bonfanti, Paolo [VerfasserIn]
Omodei, Paolo [VerfasserIn]
Tentorio, Paolo [VerfasserIn]
Castro, Pedro [VerfasserIn]
Rodrigues, Pedro M [VerfasserIn]
España, Pedro Pablo [VerfasserIn]
Hoffmann, Per [VerfasserIn]
Rosenstiel, Philip [VerfasserIn]
Schommers, Philipp [VerfasserIn]
Suwalski, Phillip [VerfasserIn]
de Pablo, Raúl [VerfasserIn]
Ferrer, Ricard [VerfasserIn]
Bals, Robert [VerfasserIn]
Gualtierotti, Roberta [VerfasserIn]
Gallego-Durán, Rocío [VerfasserIn]
Nieto, Rosa [VerfasserIn]
Carpani, Rossana [VerfasserIn]
Morilla, Rubén [VerfasserIn]
Badalamenti, Salvatore [VerfasserIn]
Haider, Sammra [VerfasserIn]
Ciesek, Sandra [VerfasserIn]
May, Sandra [VerfasserIn]
Bombace, Sara [VerfasserIn]
Marsal, Sara [VerfasserIn]
Pigazzini, Sara [VerfasserIn]
Klein, Sebastian [VerfasserIn]
Pelusi, Serena [VerfasserIn]
Wilfling, Sibylle [VerfasserIn]
Bosari, Silvano [VerfasserIn]
Volland, Sonja [VerfasserIn]
Brunak, Søren [VerfasserIn]
Raychaudhuri, Soumya [VerfasserIn]
Schreiber, Stefan [VerfasserIn]
Heilmann-Heimbach, Stefanie [VerfasserIn]
Aliberti, Stefano [VerfasserIn]
Ripke, Stephan [VerfasserIn]
Dudman, Susanne [VerfasserIn]
Wesse, Tanja [VerfasserIn]
Zheng, Tenghao [VerfasserIn]
Bahmer, Thomas [VerfasserIn]
Eggermann, Thomas [VerfasserIn]
Illig, Thomas [VerfasserIn]
Brenner, Thorsten [VerfasserIn]
Pumarola, Tomas [VerfasserIn]
Feldt, Torsten [VerfasserIn]
Folseraas, Trine [VerfasserIn]
Cejudo, Trinidad Gonzalez [VerfasserIn]
Landmesser, Ulf [VerfasserIn]
Protzer, Ulrike [VerfasserIn]
Hehr, Ute [VerfasserIn]
Rimoldi, Valeria [VerfasserIn]
Monzani, Valter [VerfasserIn]
Skogen, Vegard [VerfasserIn]
Keitel, Verena [VerfasserIn]
Kopfnagel, Verena [VerfasserIn]
Friaza, Vicente [VerfasserIn]
Andrade, Victor [VerfasserIn]
Moreno, Victor [VerfasserIn]
Albrecht, Wolfgang [VerfasserIn]
Peter, Wolfgang [VerfasserIn]
Poller, Wolfgang [VerfasserIn]
Farre, Xavier [VerfasserIn]
Yi, Xiaoli [VerfasserIn]
Wang, Xiaomin [VerfasserIn]
Khodamoradi, Yascha [VerfasserIn]
Karadeniz, Zehra [VerfasserIn]
Latiano, Anna [VerfasserIn]
Goerg, Siegfried [VerfasserIn]
Bacher, Petra [VerfasserIn]
Koehler, Philipp [VerfasserIn]
Tran, Florian [VerfasserIn]
Zoller, Heinz [VerfasserIn]
Schulte, Eva C [VerfasserIn]
Heidecker, Bettina [VerfasserIn]
Ludwig, Kerstin U [VerfasserIn]
Fernández, Javier [VerfasserIn]
Romero-Gómez, Manuel [VerfasserIn]
Albillos, Agustín [VerfasserIn]
Invernizzi, Pietro [VerfasserIn]
Buti, Maria [VerfasserIn]
Duga, Stefano [VerfasserIn]
Bujanda, Luis [VerfasserIn]
Hov, Johannes R [VerfasserIn]
Lenz, Tobias L [VerfasserIn]
Asselta, Rosanna [VerfasserIn]
de Cid, Rafael [VerfasserIn]
Valenti, Luca [VerfasserIn]
Karlsen, Tom H [VerfasserIn]
Cáceres, Mario [VerfasserIn]
Franke, Andre [VerfasserIn]

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