МОНИТОРИНГ ДОМИНИРУЮЩИХ КИШЕЧНЫХ ВИРУСОВ В СТОЧНОЙ ВОДЕ КАК ВОЗМОЖНОСТЬ ПОВЫШЕНИЯ ЭФФЕКТИВНОСТИ ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОГО НАДЗОРА ЗА ВИРУСНЫМИ ОСТРЫМИ КИШЕЧНЫМИ ИНФЕКЦИЯМИ
Введение. Мониторинг кишечных вирусов в сточной воде – новый эпидемиологический подход, позволяющий отследить интенсивность их циркуляции среди людей. Цель исследования – провести и проанализировать параллельные мониторинговые исследования сточных вод и биологического материала пациентов с вирусными острыми кишечными инфекциями (ОКИ) в отношении актуальных их возбудителей, отобранных в разных регионах Республики Беларусь. Материал и методы. Методом ПЦР в режиме реального времени исследовали 403 образца сточной воды и 381 пробу фекалий от пациентов с ОКИ, отобранных в разных регионах Беларуси. Результаты. У пациентов с ОКИ чаще всего обнаруживались ротавирусы А (20,4%) и норовирусы 2 геногруппы (10,2%), тогда как аденовирусы F (2,2%), энтеровирусы (0,8%) и норовирусы 1 геногруппы (0,3%) выявлялись довольно редко. В сточных водах доминировали аденовирусы F (25,9%), ротавирусы А (18,4%) и энтеровирусы (13,4%), норовирусы 2 (6,8%) и норовирусы 1 геногрупп детектировались значительно реже (1,5%). Выявлены определенные различия в долевой структуре возбудителей вирусных ОКИ, присутствующих у пациентов и обнаруженных в сточных водах, что указывает на активную скрытую циркуляцию некоторых из них (аденовирусов F и энтеровирусов). В одной из проб сточной воды выявлен коронавирус SARS-CoV-2. Проведенное секвенирование и биоинформационный анализ его нуклеотидной последовательности выявили 100% сходство с последовательностями изолятов, идентифицированных у пациентов с COVID-19. Выводы. Полученные данные указывают на перспективность исследований по мониторингу кишечных вирусов в сточных водах с целью повышения эффективности эпидемиологического надзора за циркуляцией известных возбудителей ОКИ и выявления новых и вновь появляющихся кишечных патогенов..
Medienart: |
E-Artikel |
---|
Erscheinungsjahr: |
2021 |
---|---|
Erschienen: |
2021 |
Enthalten in: |
Zur Gesamtaufnahme - volume:4 |
---|---|
Enthalten in: |
Гепатология и гастроэнтерология - 4(2021), 2, Seite 201-206 |
Sprache: |
bel ; Englisch ; Russisch |
---|
Beteiligte Personen: |
T. V. Amvrosieva [VerfasserIn] |
---|
Links: |
doi.org [kostenfrei] |
---|
Themen: |
кишечные вирусы, оки, лабораторная диагностика, sars-cov-2, сточная вода |
---|
doi: |
10.25298/2616-5546-2020-4-2-201-206 |
---|
funding: |
|
---|---|
Förderinstitution / Projekttitel: |
|
PPN (Katalog-ID): |
DOAJ004020502 |
---|
LEADER | 01000caa a22002652 4500 | ||
---|---|---|---|
001 | DOAJ004020502 | ||
003 | DE-627 | ||
005 | 20230502095755.0 | ||
007 | cr uuu---uuuuu | ||
008 | 230225s2021 xx |||||o 00| ||bel c | ||
024 | 7 | |a 10.25298/2616-5546-2020-4-2-201-206 |2 doi | |
035 | |a (DE-627)DOAJ004020502 | ||
035 | |a (DE-599)DOAJ01d318a0973a47a59804338a23489af6 | ||
040 | |a DE-627 |b ger |c DE-627 |e rakwb | ||
041 | |a bel |a eng |a rus | ||
050 | 0 | |a RC799-869 | |
100 | 0 | |a T. V. Amvrosieva |e verfasserin |4 aut | |
245 | 1 | 0 | |a МОНИТОРИНГ ДОМИНИРУЮЩИХ КИШЕЧНЫХ ВИРУСОВ В СТОЧНОЙ ВОДЕ КАК ВОЗМОЖНОСТЬ ПОВЫШЕНИЯ ЭФФЕКТИВНОСТИ ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОГО НАДЗОРА ЗА ВИРУСНЫМИ ОСТРЫМИ КИШЕЧНЫМИ ИНФЕКЦИЯМИ |
264 | 1 | |c 2021 | |
336 | |a Text |b txt |2 rdacontent | ||
337 | |a Computermedien |b c |2 rdamedia | ||
338 | |a Online-Ressource |b cr |2 rdacarrier | ||
520 | |a Введение. Мониторинг кишечных вирусов в сточной воде – новый эпидемиологический подход, позволяющий отследить интенсивность их циркуляции среди людей. Цель исследования – провести и проанализировать параллельные мониторинговые исследования сточных вод и биологического материала пациентов с вирусными острыми кишечными инфекциями (ОКИ) в отношении актуальных их возбудителей, отобранных в разных регионах Республики Беларусь. Материал и методы. Методом ПЦР в режиме реального времени исследовали 403 образца сточной воды и 381 пробу фекалий от пациентов с ОКИ, отобранных в разных регионах Беларуси. Результаты. У пациентов с ОКИ чаще всего обнаруживались ротавирусы А (20,4%) и норовирусы 2 геногруппы (10,2%), тогда как аденовирусы F (2,2%), энтеровирусы (0,8%) и норовирусы 1 геногруппы (0,3%) выявлялись довольно редко. В сточных водах доминировали аденовирусы F (25,9%), ротавирусы А (18,4%) и энтеровирусы (13,4%), норовирусы 2 (6,8%) и норовирусы 1 геногрупп детектировались значительно реже (1,5%). Выявлены определенные различия в долевой структуре возбудителей вирусных ОКИ, присутствующих у пациентов и обнаруженных в сточных водах, что указывает на активную скрытую циркуляцию некоторых из них (аденовирусов F и энтеровирусов). В одной из проб сточной воды выявлен коронавирус SARS-CoV-2. Проведенное секвенирование и биоинформационный анализ его нуклеотидной последовательности выявили 100% сходство с последовательностями изолятов, идентифицированных у пациентов с COVID-19. Выводы. Полученные данные указывают на перспективность исследований по мониторингу кишечных вирусов в сточных водах с целью повышения эффективности эпидемиологического надзора за циркуляцией известных возбудителей ОКИ и выявления новых и вновь появляющихся кишечных патогенов. | ||
650 | 4 | |a кишечные вирусы, оки, лабораторная диагностика, sars-cov-2, сточная вода | |
653 | 0 | |a Diseases of the digestive system. Gastroenterology | |
700 | 0 | |a N. V. Paklonskaya |e verfasserin |4 aut | |
700 | 0 | |a I. V. Belskaya |e verfasserin |4 aut | |
700 | 0 | |a Y. B. Koltunova |e verfasserin |4 aut | |
700 | 0 | |a Y. A. Shilova |e verfasserin |4 aut | |
773 | 0 | 8 | |i In |t Гепатология и гастроэнтерология |d Educational Institution "Grodno State Medical University", 2021 |g 4(2021), 2, Seite 201-206 |w (DE-627)DOAJ078607965 |x 27085309 |7 nnns |
773 | 1 | 8 | |g volume:4 |g year:2021 |g number:2 |g pages:201-206 |
856 | 4 | 0 | |u https://doi.org/10.25298/2616-5546-2020-4-2-201-206 |z kostenfrei |
856 | 4 | 0 | |u https://doaj.org/article/01d318a0973a47a59804338a23489af6 |z kostenfrei |
856 | 4 | 0 | |u http://hepatogastro.grsmu.by/index.php/journalHandG/article/view/167 |z kostenfrei |
856 | 4 | 2 | |u https://doaj.org/toc/2616-5546 |y Journal toc |z kostenfrei |
856 | 4 | 2 | |u https://doaj.org/toc/2708-5309 |y Journal toc |z kostenfrei |
912 | |a GBV_USEFLAG_A | ||
912 | |a GBV_DOAJ | ||
912 | |a SSG-OLC-PHA | ||
951 | |a AR | ||
952 | |d 4 |j 2021 |e 2 |h 201-206 |