МОНИТОРИНГ ДОМИНИРУЮЩИХ КИШЕЧНЫХ ВИРУСОВ В СТОЧНОЙ ВОДЕ КАК ВОЗМОЖНОСТЬ ПОВЫШЕНИЯ ЭФФЕКТИВНОСТИ ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОГО НАДЗОРА ЗА ВИРУСНЫМИ ОСТРЫМИ КИШЕЧНЫМИ ИНФЕКЦИЯМИ

Введение. Мониторинг кишечных вирусов в сточной воде – новый эпидемиологический подход, позволяющий отследить интенсивность их циркуляции среди людей. Цель исследования – провести и проанализировать параллельные мониторинговые исследования сточных вод и биологического материала пациентов с вирусными острыми кишечными инфекциями (ОКИ) в отношении актуальных их возбудителей, отобранных в разных регионах Республики Беларусь. Материал и методы. Методом ПЦР в режиме реального времени исследовали 403 образца сточной воды и 381 пробу фекалий от пациентов с ОКИ, отобранных в разных регионах Беларуси. Результаты. У пациентов с ОКИ чаще всего обнаруживались ротавирусы А (20,4%) и норовирусы 2 геногруппы (10,2%), тогда как аденовирусы F (2,2%), энтеровирусы (0,8%) и норовирусы 1 геногруппы (0,3%) выявлялись довольно редко. В сточных водах доминировали аденовирусы F (25,9%), ротавирусы А (18,4%) и энтеровирусы (13,4%), норовирусы 2 (6,8%) и норовирусы 1 геногрупп детектировались значительно реже (1,5%). Выявлены определенные различия в долевой структуре возбудителей вирусных ОКИ, присутствующих у пациентов и обнаруженных в сточных водах, что указывает на активную скрытую циркуляцию некоторых из них (аденовирусов F и энтеровирусов). В одной из проб сточной воды выявлен коронавирус SARS-CoV-2. Проведенное секвенирование и биоинформационный анализ его нуклеотидной последовательности выявили 100% сходство с последовательностями изолятов, идентифицированных у пациентов с COVID-19. Выводы. Полученные данные указывают на перспективность исследований по мониторингу кишечных вирусов в сточных водах с целью повышения эффективности эпидемиологического надзора за циркуляцией известных возбудителей ОКИ и выявления новых и вновь появляющихся кишечных патогенов..

Medienart:

E-Artikel

Erscheinungsjahr:

2021

Erschienen:

2021

Enthalten in:

Zur Gesamtaufnahme - volume:4

Enthalten in:

Гепатология и гастроэнтерология - 4(2021), 2, Seite 201-206

Sprache:

bel ; Englisch ; Russisch

Beteiligte Personen:

T. V. Amvrosieva [VerfasserIn]
N. V. Paklonskaya [VerfasserIn]
I. V. Belskaya [VerfasserIn]
Y. B. Koltunova [VerfasserIn]
Y. A. Shilova [VerfasserIn]

Links:

doi.org [kostenfrei]
doaj.org [kostenfrei]
hepatogastro.grsmu.by [kostenfrei]
Journal toc [kostenfrei]
Journal toc [kostenfrei]

Themen:

кишечные вирусы, оки, лабораторная диагностика, sars-cov-2, сточная вода
Diseases of the digestive system. Gastroenterology

doi:

10.25298/2616-5546-2020-4-2-201-206

funding:

Förderinstitution / Projekttitel:

PPN (Katalog-ID):

DOAJ004020502