Details der Publikation - Proteomics-based identification and characterization of components in the avrRpm1-RPM1 "gene-for-gene" defense response

Proteomics-based identification and characterization of components in the avrRpm1-RPM1 "gene-for-gene" defense response / von Ivy Widjaja

Microsomal, Rubisco, Jasmonic acid, Ethylene, lipid raft..

Für Proteomanalysen wurden transgene Arabidopsis verwendet, welche den bakteriellen Typ III Effektor avrRpm1 unter der Kontrolle eines Dexamethasone-induzierbaren Promotor exprimieren. Bei diesen Analysen konnten insgesamt 34 unterschiedlich regulierte Proteine identifiziert werden. Vier dieser Proteine (ein Remorin, eine Protein-Phosphatase 2C, ein RNA-binde Protein und ein C2-Domäne-enthaltendes Protein) sind potentielle frühe Signalkomponenten in der Interaktion zwischen AvrRpm1 und dem Resistenzgen RPM1. Mittels „gain-of-function“- und „loss-of-function“- Ansätzen wurden die funktionellen Rollen der Protein-Phosphatase 2C (umbenannt in PIA1 für PP2C induziert durch avrRpm1-1) und von AtREM1.2 (Remorin) nach RPM1-vermittelter Abwehrantwort untersucht. Ohne Infektion, reprimiert PIA1 die Expression von PR5, PDF1.2 und ACS6. Nach der Erkennung von avrRpm1, aber nicht von avrB, wird PIA1 induziert, was zur negativen Regulierung der Abwehrantwort führt, die von RPM1 initiiert wird. Dies geschieht wahrscheinlich „downstream“ der RIN4 Phosphorylierung. PIA1 reprimiert auch die Expression von MMP2, einem avrRPM1-responsiven Gen, welches möglichweise zur Unterdrückung von Abwehrreaktionen beitragen kann. Während der RPM1-vermittelten Resistenz, reguliert PIA1 die Expression von PR-Genen positiv. Diese Regulierung findet wahrscheinlich „downstream“ der SA-Akkumulation statt. AtREM1.2 scheint auch als ein negativer Regulator einer RPM1-vermittelten Resistenz zu agieren, welche wahrscheinlich durch Phosphorylierung aktiviert wird. Die Phosphorylierung von AtREM1.2 ist „downstream“ der RIN4-Phosphorylierung und befindet sich „upstream“ oder ist unabhängig von der PIA1 Hochregulierung..

Medienart:	E-Book

Erscheinungsjahr:	2009
Erschienen:	2009

Weitere Ausgaben:	Druckausg.: Proteomics-based identification and characterization of components in the avrRpm1-RPM1 "gene-for-gene" defense response

Sprache:	Englisch

Beteiligte Personen:	Widjaja, Ivy [VerfasserIn] Scheel, Dierk, 1950-2022 [Sonstige Person] Klösgen, Ralf Bernd [Sonstige Person] Oelmüller, Ralf [Sonstige Person]
Hochschulschrift:	Halle, Univ., Naturwissenschaftliche Fakultät I, Diss., 2009

Links:	Volltext Volltext Volltext Volltext Volltext [kostenfrei]

BKL:	42.13 / Molekularbiologie
Themen:	Hochschulschrift

Anmerkungen:	Tag der Verteidigung: 28.05.2009

Umfang:	Online-Ressource (104 Bl. = 6,24 mb) ; graph. Darst.

doi:	10.25673/431
Weitere IDs:	urn:nbn:de:gbv:3:4-476

funding:
Förderinstitution / Projekttitel:

PPN (Katalog-ID):	603392830

Internformat


LEADER	01000cam a2200265 4500
001	603392830
003	DE-627
005	20230428163215.0
007	cr uuu---uuuuu
008	090630s2009 gw \|\|\|\|\|om 00\| \|\|eng c
015			\|a 12,O09 \|2 dnb
016	7		\|a 1024873595 \|2 DE-101
024	7		\|a urn:nbn:de:gbv:3:4-476 \|2 urn
024	7		\|a 10.25673/431 \|2 doi
035			\|a (DE-627)603392830
035			\|a (DE-599)GBV603392830
035			\|a (OCoLC)863090304
040			\|a DE-627 \|b ger \|c DE-627 \|e rakwb
041			\|a eng \|b ger
044			\|c XA-DE
082	0	4	\|a 570 \|q DNB
084			\|a 42.13 \|2 bkl
100	1		\|a Widjaja, Ivy \|e verfasserin \|4 aut
245	1	0	\|a Proteomics-based identification and characterization of components in the avrRpm1-RPM1 "gene-for-gene" defense response \|c von Ivy Widjaja
264		1	\|c 2009
300			\|a Online-Ressource (104 Bl. = 6,24 mb) \|b graph. Darst.
336			\|a Text \|b txt \|2 rdacontent
337			\|a Computermedien \|b c \|2 rdamedia
338			\|a Online-Ressource \|b cr \|2 rdacarrier
500			\|a Tag der Verteidigung: 28.05.2009
502			\|a Halle, Univ., Naturwissenschaftliche Fakultät I, Diss., 2009
520			\|a Microsomal, Rubisco, Jasmonic acid, Ethylene, lipid raft.
520			\|a Für Proteomanalysen wurden transgene Arabidopsis verwendet, welche den bakteriellen Typ III Effektor avrRpm1 unter der Kontrolle eines Dexamethasone-induzierbaren Promotor exprimieren. Bei diesen Analysen konnten insgesamt 34 unterschiedlich regulierte Proteine identifiziert werden. Vier dieser Proteine (ein Remorin, eine Protein-Phosphatase 2C, ein RNA-binde Protein und ein C2-Domäne-enthaltendes Protein) sind potentielle frühe Signalkomponenten in der Interaktion zwischen AvrRpm1 und dem Resistenzgen RPM1. Mittels „gain-of-function“- und „loss-of-function“- Ansätzen wurden die funktionellen Rollen der Protein-Phosphatase 2C (umbenannt in PIA1 für PP2C induziert durch avrRpm1-1) und von AtREM1.2 (Remorin) nach RPM1-vermittelter Abwehrantwort untersucht. Ohne Infektion, reprimiert PIA1 die Expression von PR5, PDF1.2 und ACS6. Nach der Erkennung von avrRpm1, aber nicht von avrB, wird PIA1 induziert, was zur negativen Regulierung der Abwehrantwort führt, die von RPM1 initiiert wird. Dies geschieht wahrscheinlich „downstream“ der RIN4 Phosphorylierung. PIA1 reprimiert auch die Expression von MMP2, einem avrRPM1-responsiven Gen, welches möglichweise zur Unterdrückung von Abwehrreaktionen beitragen kann. Während der RPM1-vermittelten Resistenz, reguliert PIA1 die Expression von PR-Genen positiv. Diese Regulierung findet wahrscheinlich „downstream“ der SA-Akkumulation statt. AtREM1.2 scheint auch als ein negativer Regulator einer RPM1-vermittelten Resistenz zu agieren, welche wahrscheinlich durch Phosphorylierung aktiviert wird. Die Phosphorylierung von AtREM1.2 ist „downstream“ der RIN4-Phosphorylierung und befindet sich „upstream“ oder ist unabhängig von der PIA1 Hochregulierung.
583	1		\|z Langzeitarchivierung gewährleistet \|2 pdager
655		7	\|a Hochschulschrift \|0 (DE-588)4113937-9 \|0 (DE-627)105825778 \|0 (DE-576)209480580 \|2 gnd-content
700	1		\|a Scheel, Dierk \|d 1950-2022 \|e gutachter \|0 (DE-588)1260391531 \|0 (DE-627)1807264173 \|4 oth
700	1		\|a Klösgen, Ralf Bernd \|c Prof. Dr. \|e gutachter \|4 oth
700	1		\|a Oelmüller, Ralf \|c Prof. Dr. \|e gutachter \|4 oth
751			\|a Halle \|4 uvp
776	0	8	\|i Druckausg. \|a Widjaja, Ivy \|t Proteomics-based identification and characterization of components in the avrRpm1-RPM1 "gene-for-gene" defense response \|d 2009 \|h 104 Bl. \|w (DE-627)603390781
856	4	0	\|u https://opendata.uni-halle.de/handle/1981185920/7065 \|x Verlag \|3 Volltext
856	4	0	\|u http://dx.doi.org/10.25673/431 \|x Resolving-System \|3 Volltext
856	4	0	\|u http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:gbv:3:4-476 \|x Resolving-System \|3 Volltext
856	4	0	\|u http://d-nb.info/1024873595/34 \|x Langzeitarchivierung Nationalbibliothek \|3 Volltext
856	4	0	\|u http://digital.bibliothek.uni-halle.de/urn/urn:nbn:de:gbv:3:4-476 \|x Verlag \|z kostenfrei \|3 Volltext
912			\|a GBV-ODiss
912			\|a GBV_ILN_20
912			\|a ISIL_DE-84
912			\|a SYSFLAG_1
912			\|a GBV_KXP
912			\|a SSG-OLC-PHA
912			\|a GBV_ILN_21
912			\|a ISIL_DE-46
912			\|a GBV_ILN_22
912			\|a ISIL_DE-18
912			\|a GBV_ILN_23
912			\|a ISIL_DE-830
912			\|a GBV_ILN_30
912			\|a ISIL_DE-104
912			\|a GBV_ILN_40
912			\|a ISIL_DE-7
912			\|a GBV_ILN_60
912			\|a ISIL_DE-705
912			\|a GBV_ILN_64
912			\|a GBV_ILN_65
912			\|a ISIL_DE-3
912			\|a GBV_ILN_70
912			\|a ISIL_DE-89
912			\|a GBV_ILN_105
912			\|a ISIL_DE-841
912			\|a GBV_ILN_110
912			\|a ISIL_DE-Luen4
912			\|a GBV_ILN_132
912			\|a ISIL_DE-959
912			\|a GBV_ILN_151
912			\|a ISIL_DE-546
912			\|a GBV_ILN_161
912			\|a ISIL_DE-960
912			\|a GBV_ILN_213
912			\|a ISIL_DE-551
912			\|a GBV_ILN_293
912			\|a ISIL_DE-960-3
936	b	k	\|a 42.13 \|j Molekularbiologie \|0 (DE-627)106410458
951			\|a BO
980			\|2 20 \|1 01 \|x 0084 \|b 1271461196 \|y x \|z 06-10-11
980			\|2 21 \|1 01 \|x 0046 \|b 1331999154 \|y z \|z 12-10-12
980			\|2 22 \|1 01 \|x 0018 \|b 1332105823 \|h SUBolrd \|y xu \|z 12-10-12
980			\|2 23 \|1 01 \|x 0830 \|b 1332200435 \|h olr-d \|y x \|z 12-10-12
980			\|2 30 \|1 01 \|x 0104 \|b 1332251250 \|y z \|z 12-10-12
980			\|2 40 \|1 01 \|x 0007 \|b 133229572X \|y xsn \|z 12-10-12
980			\|2 60 \|1 01 \|x 0705 \|b 1332396879 \|h OLRD \|y z \|z 12-10-12
980			\|2 64 \|1 01 \|x 3064 \|b 939546094 \|y x \|z 30-06-09
980			\|2 65 \|1 01 \|x 0003 \|b 93954542X \|c 03 \|f --%%-- \|d eThesis \|e --%%-- \|j --%%-- \|c 09 \|f --%%-- \|d 09 H 99 \|e --%%-- \|j --%%-- \|y k3on \|z 30-06-09
980			\|2 70 \|1 01 \|x 0089 \|b 1332540503 \|y zdo \|z 12-10-12
980			\|2 105 \|1 01 \|x 0841 \|b 1595987754 \|y z \|z 21-01-16
980			\|2 110 \|1 01 \|x 3110 \|b 1332496105 \|y x \|z 12-10-12
980			\|2 132 \|1 01 \|x 0959 \|b 1497524571 \|h OLR-DISS \|y x \|z 11-08-14
980			\|2 151 \|1 01 \|x 0546 \|b 3594080625 \|h OLR-ODISS \|y z \|z 13-02-20
980			\|2 161 \|1 01 \|x 0960 \|b 1597417084 \|h ORD \|y x \|z 28-01-16
980			\|2 213 \|1 01 \|x 0551 \|b 1332568483 \|h ORD \|y x \|z 12-10-12
980			\|2 293 \|1 01 \|x 3293 \|b 1597837326 \|h ORD \|y xf \|z 28-01-16
981			\|2 21 \|1 01 \|x 0046 \|r http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:gbv:3:4-476
981			\|2 22 \|1 01 \|x 0018 \|r http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:gbv:3:4-476
981			\|2 23 \|1 01 \|x 0830 \|r http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:gbv:3:4-476
981			\|2 30 \|1 01 \|x 0104 \|r http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:gbv:3:4-476
981			\|2 40 \|1 01 \|x 0007 \|r http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:gbv:3:4-476
981			\|2 60 \|1 01 \|x 0705 \|r http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:gbv:3:4-476
981			\|2 70 \|1 01 \|x 0089 \|r http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:gbv:3:4-476
981			\|2 105 \|1 01 \|x 0841 \|r http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:gbv:3:4-476
981			\|2 110 \|1 01 \|x 3110 \|r http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:gbv:3:4-476
981			\|2 132 \|1 01 \|x 0959 \|r http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:gbv:3:4-476
981			\|2 151 \|1 01 \|x 0546 \|y Volltext \|r http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:gbv:3:4-476
981			\|2 161 \|1 01 \|x 0960 \|r http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:gbv:3:4-476
981			\|2 213 \|1 01 \|x 0551 \|r http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:gbv:3:4-476
981			\|2 293 \|1 01 \|x 3293 \|r http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:gbv:3:4-476
982			\|2 64 \|1 00 \|x 3064 \|8 00 \|0 (DE-627)527504033 \|a Institut für Biologie <Halle, Saale>
982			\|2 64 \|1 00 \|x 3064 \|8 01 \|0 (DE-627)355383551 \|a Promotion
983			\|2 60 \|1 01 \|x 0705 \|8 10 \|a ho
983			\|2 64 \|1 01 \|x 3064 \|8 99 \|a j2009
985			\|2 110 \|1 01 \|x 3110 \|a OLRD
995			\|2 22 \|1 01 \|x 0018 \|a SUBolrd
995			\|2 23 \|1 01 \|x 0830 \|a olr-d
995			\|2 60 \|1 01 \|x 0705 \|a OLRD
995			\|2 132 \|1 01 \|x 0959 \|a OLR-DISS
995			\|2 151 \|1 01 \|x 0546 \|a OLR-ODISS
995			\|2 161 \|1 01 \|x 0960 \|a ORD
995			\|2 213 \|1 01 \|x 0551 \|a ORD
995			\|2 293 \|1 01 \|x 3293 \|a ORD
998			\|2 23 \|1 01 \|x 0830 \|0 2012-10-12:19:34:14

Proteomics-based identification and characterization of components in the avrRpm1-RPM1 "gene-for-gene" defense response / von Ivy Widjaja

Zugang & Verfügbarkeit

Zugehörige Publikationen/Bände