Polymerase Chain Reaction-Based Identity Assay for Pathogenic Turkey Eimeria
Diagnosis of turkey Eimeria infection by conventional parasitologic methods is challenging and, until now, no molecular tools existed that clearly distinguished the four widely recognized pathogenic species: Eimeria adenoeides, E. meleagrimitis, E. gallopavonis, and E. dispersa. In this study, the internal transcribed spacer region one (ITS-1) was amplified and sequenced from 23 conventionally characterized reference samples. Phylogenic analysis segregated samples into five distinct cluster groups. The ITS-1 region(s) within each cluster were of a particular length and shared from 96% to 100% identity, while amplified ITS-1 region(s) between clusters differed in length and shared only 10.6% to 49.7% sequence identity. In addition, we developed PCR primer sets as diagnostic tools capable of specifically identifying members of each of the five clusters. El diagnóstico de la infección por Eimeria de pavos mediante los métodos parasitológicos convencionales es difícil y hasta ahora no se disponía de herramientas moleculares que distinguieran claramente a las cuatro especies patógenas ampliamente reconocidas que son: Eimeria adenoeides, E. meleagrimitis, E. gallopavonis y E. dispersa. En este estudio, se amplificó y se secuenció la región espaciadora transcrita interna número uno (región ITS-1 por sus siglas en inglés) de 23 muestras de referencia caracterizadas convencionalmente. El análisis filogenetico agrupó a las muestras en cinco grupos distintos. La región ITS-1 dentro de cada grupo mostró una longitud particular y compartió una identidad genética del 96% al 100%, mientras que las regiones ITS-1 entre los diferentes grupos mostraron longitudes diferentes y solamente compartían identidades de 10.6% a 49.7% en sus secuencias. Además se desarrollaron pares de iniciadores para la reacción en cadena de la polimerasa que pueden ser utilizados en el diagnóstico y que son capaces de identificar de manera específica a los miembros de los cinco grupos..
| Medienart: |
E-Artikel |
|---|
| Erscheinungsjahr: |
2010 |
|---|---|
| Erschienen: |
2010 |
| Enthalten in: |
Zur Gesamtaufnahme - volume:54 |
|---|
| Sprache: |
Englisch |
|---|
| Beteiligte Personen: |
Cook, Stephanie M. [VerfasserIn] |
|---|
| Links: |
|---|
| Themen: |
Applied sciences |
|---|
| Förderinstitution / Projekttitel: |
|
|---|
| PPN (Katalog-ID): |
JST012186147 |
|---|
| LEADER | 01000caa a22002652 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | JST012186147 | ||
| 003 | DE-627 | ||
| 005 | 20240114233617.0 | ||
| 007 | cr uuu---uuuuu | ||
| 008 | 150323s2010 xx |||||o 00| ||eng c | ||
| 035 | |a (DE-627)JST012186147 | ||
| 035 | |a (JST)40983043 | ||
| 040 | |a DE-627 |b ger |c DE-627 |e rakwb | ||
| 041 | |a eng | ||
| 100 | 1 | |a Cook, Stephanie M. |e verfasserin |4 aut | |
| 245 | 1 | 0 | |a Polymerase Chain Reaction-Based Identity Assay for Pathogenic Turkey Eimeria |
| 264 | 1 | |c 2010 | |
| 336 | |a Text |b txt |2 rdacontent | ||
| 337 | |a Computermedien |b c |2 rdamedia | ||
| 338 | |a Online-Ressource |b cr |2 rdacarrier | ||
| 520 | |a Diagnosis of turkey Eimeria infection by conventional parasitologic methods is challenging and, until now, no molecular tools existed that clearly distinguished the four widely recognized pathogenic species: Eimeria adenoeides, E. meleagrimitis, E. gallopavonis, and E. dispersa. In this study, the internal transcribed spacer region one (ITS-1) was amplified and sequenced from 23 conventionally characterized reference samples. Phylogenic analysis segregated samples into five distinct cluster groups. The ITS-1 region(s) within each cluster were of a particular length and shared from 96% to 100% identity, while amplified ITS-1 region(s) between clusters differed in length and shared only 10.6% to 49.7% sequence identity. In addition, we developed PCR primer sets as diagnostic tools capable of specifically identifying members of each of the five clusters. El diagnóstico de la infección por Eimeria de pavos mediante los métodos parasitológicos convencionales es difícil y hasta ahora no se disponía de herramientas moleculares que distinguieran claramente a las cuatro especies patógenas ampliamente reconocidas que son: Eimeria adenoeides, E. meleagrimitis, E. gallopavonis y E. dispersa. En este estudio, se amplificó y se secuenció la región espaciadora transcrita interna número uno (región ITS-1 por sus siglas en inglés) de 23 muestras de referencia caracterizadas convencionalmente. El análisis filogenetico agrupó a las muestras en cinco grupos distintos. La región ITS-1 dentro de cada grupo mostró una longitud particular y compartió una identidad genética del 96% al 100%, mientras que las regiones ITS-1 entre los diferentes grupos mostraron longitudes diferentes y solamente compartían identidades de 10.6% a 49.7% en sus secuencias. Además se desarrollaron pares de iniciadores para la reacción en cadena de la polimerasa que pueden ser utilizados en el diagnóstico y que son capaces de identificar de manera específica a los miembros de los cinco grupos. | ||
| 540 | |a Copyright 2010 American Association of Avian Pathologists, Inc. | ||
| 650 | 4 | |a Applied sciences |x Laboratory techniques |x Nucleic acid amplification techniques |x Polymerase chain reaction | |
| 650 | 4 | |a Biological sciences |x Biology |x Zoology |x Animals |x Birds |x Poultry |x Turkeys | |
| 650 | 4 | |a Physical sciences |x Chemistry |x Chemical compounds |x Chemicals |x Acids |x Nucleic acids |x DNA | |
| 650 | 4 | |a Biological sciences |x Biology |x Parasitology |x Parasitism | |
| 650 | 4 | |a Biological sciences |x Biology |x Biological taxonomies | |
| 650 | 4 | |a Biological sciences |x Biology |x Zoology |x Animals |x Birds |x Poultry |x Chickens | |
| 650 | 4 | |a Health sciences |x Medical conditions |x Symptoms |x Physical symptoms |x Cysts |x Oocysts | |
| 650 | 4 | |a Behavioral sciences |x Psychology |x Social psychology |x Group identity |x Regional identity | |
| 650 | 4 | |a Applied sciences |x Materials science |x Materials |x Gels | |
| 650 | 4 | |a Biological sciences |x Biology |x Genetics |x Molecular genetics |x Gene structures |x Nucleotide sequences | |
| 655 | 4 | |a research-article | |
| 700 | 1 | |a Higuchi, Deborrah S. |e verfasserin |4 aut | |
| 700 | 1 | |a McGowan, Alexandria L. |e verfasserin |4 aut | |
| 700 | 1 | |a Schrader, Joan S. |e verfasserin |4 aut | |
| 700 | 1 | |a Withanage, G. S. K. |e verfasserin |4 aut | |
| 700 | 1 | |a Francis, Michael J. |e verfasserin |4 aut | |
| 773 | 1 | 8 | |g volume:54 |g year:2010 |g number:4 |g pages:1152-1156 |
| 856 | 4 | 0 | |u https://www.jstor.org/stable/40983043 |3 Volltext |
| 912 | |a GBV_USEFLAG_A | ||
| 912 | |a GBV_JST | ||
| 951 | |a AR | ||
| 952 | |d 54 |j 2010 |e 4 |h 1152-1156 | ||